MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 5500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	CTG	2	6	701	706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246495
2	NT_187115	CTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246495
3	NT_187115	CGA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246495
4	NT_187115	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
5	NT_187115	GCAG	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	409246496
6	NT_187115	ACC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246496
7	NT_187115	GAC	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
8	NT_187115	CTG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
9	NT_187115	CAAT	2	8	1243	1250	50 %	25 %	0 %	25 %	409246496
10	NT_187115	CGGT	2	8	1266	1273	0 %	25 %	50 %	25 %	409246496
11	NT_187115	ACCTT	2	10	1305	1314	20 %	40 %	0 %	40 %	409246496
12	NT_187115	CAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
13	NT_187115	ATC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
14	NT_187115	GCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
15	NT_187115	CTGCG	2	10	1472	1481	0 %	20 %	40 %	40 %	409246496
16	NT_187115	CTG	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
17	NT_187115	GC	3	6	1539	1544	0 %	0 %	50 %	50 %	409246496
18	NT_187115	CAG	2	6	1577	1582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
19	NT_187115	ACG	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
20	NT_187115	ATA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
21	NT_187115	CCG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
22	NT_187115	CGC	2	6	1832	1837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
23	NT_187115	ATG	2	6	1848	1853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246496
24	NT_187115	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246496
25	NT_187115	GCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
26	NT_187115	GT	3	6	1997	2002	0 %	50 %	50 %	0 %	409246496
27	NT_187115	CGC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
28	NT_187115	GCGCG	2	10	2067	2076	0 %	0 %	60 %	40 %	409246496
29	NT_187115	GTC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
30	NT_187115	ATC	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
31	NT_187115	CG	5	10	2428	2437	0 %	0 %	50 %	50 %	409246496
32	NT_187115	TCG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
33	NT_187115	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
34	NT_187115	TTC	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
35	NT_187115	CAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
36	NT_187115	CTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
37	NT_187115	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
38	NT_187115	AGA	2	6	2746	2751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
39	NT_187115	CG	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	409246496
40	NT_187115	AAT	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
41	NT_187115	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
42	NT_187115	GCA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
43	NT_187115	TTA	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
44	NT_187115	TCAA	2	8	2946	2953	50 %	25 %	0 %	25 %	409246496
45	NT_187115	TCT	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
46	NT_187115	GCC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
47	NT_187115	AGA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
48	NT_187115	GC	3	6	3250	3255	0 %	0 %	50 %	50 %	409246496
49	NT_187115	ATA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
50	NT_187115	CG	3	6	3286	3291	0 %	0 %	50 %	50 %	409246496
51	NT_187115	CTT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
52	NT_187115	TCG	3	9	3327	3335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
53	NT_187115	CGT	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
54	NT_187115	GAA	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
55	NT_187115	C	6	6	3522	3527	0 %	0 %	0 %	100 %	409246496
56	NT_187115	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
57	NT_187115	ACA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
58	NT_187115	CTG	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
59	NT_187115	TCA	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246497
60	NT_187115	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	409246497
61	NT_187115	TCT	2	6	4759	4764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246498
62	NT_187115	CGGCG	2	10	4889	4898	0 %	0 %	60 %	40 %	409246498
63	NT_187115	CAC	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246498
64	NT_187115	ACG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
65	NT_187115	CCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
66	NT_187115	GTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246498
67	NT_187115	TGA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
68	NT_187115	TCA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246498
69	NT_187115	CGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
70	NT_187115	TATCGA	2	12	5314	5325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409246498
71	NT_187115	TGCG	2	8	5335	5342	0 %	25 %	50 %	25 %	409246498
72	NT_187115	CGA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
73	NT_187115	CCGC	2	8	5487	5494	0 %	0 %	25 %	75 %	409246498
74	NT_187115	ATG	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
75	NT_187115	TGC	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
76	NT_187115	TGTT	2	8	5631	5638	0 %	75 %	25 %	0 %	409246498
77	NT_187115	TCG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
78	NT_187115	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246498
79	NT_187115	TTG	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246499
80	NT_187115	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
81	NT_187115	CGC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
82	NT_187115	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246499
83	NT_187115	GCC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
84	NT_187115	CCGGC	2	10	5911	5920	0 %	0 %	40 %	60 %	409246499
85	NT_187115	TGC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
86	NT_187115	CACG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	25 %	50 %	409246499
87	NT_187115	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246499
88	NT_187115	GCCA	2	8	6129	6136	25 %	0 %	25 %	50 %	409246499
89	NT_187115	GCC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
90	NT_187115	CTG	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
91	NT_187115	CG	3	6	6175	6180	0 %	0 %	50 %	50 %	409246499
92	NT_187115	GTCA	2	8	6227	6234	25 %	25 %	25 %	25 %	409246499
93	NT_187115	GCA	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
94	NT_187115	GGCT	2	8	6860	6867	0 %	25 %	50 %	25 %	409246500
95	NT_187115	TGA	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
96	NT_187115	TGC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
97	NT_187115	GCG	2	6	6907	6912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
98	NT_187115	GA	3	6	6920	6925	50 %	0 %	50 %	0 %	409246500
99	NT_187115	TTTTG	2	10	6933	6942	0 %	80 %	20 %	0 %	409246500
100	NT_187115	AGT	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
101	NT_187115	CG	3	6	7187	7192	0 %	0 %	50 %	50 %	409246500
102	NT_187115	ATA	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
103	NT_187115	GAT	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
104	NT_187115	CGG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
105	NT_187115	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
106	NT_187115	CGG	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
107	NT_187115	TGTC	2	8	7501	7508	0 %	50 %	25 %	25 %	409246500
108	NT_187115	GCT	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
109	NT_187115	CTG	2	6	7608	7613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
110	NT_187115	GTT	2	6	7623	7628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246500
111	NT_187115	CGC	2	6	7637	7642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
112	NT_187115	TGC	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
113	NT_187115	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
114	NT_187115	CGT	2	6	7698	7703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
115	NT_187115	TGC	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
116	NT_187115	GCA	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
117	NT_187115	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
118	NT_187115	GA	3	6	7794	7799	50 %	0 %	50 %	0 %	409246500
119	NT_187115	TTC	2	6	8135	8140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
120	NT_187115	CTG	2	6	8155	8160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
121	NT_187115	TCA	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246501
122	NT_187115	CAG	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246501
123	NT_187115	T	6	6	8279	8284	0 %	100 %	0 %	0 %	409246501
124	NT_187115	CGG	2	6	8348	8353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246501
125	NT_187115	CCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246501
126	NT_187115	TGTT	2	8	8411	8418	0 %	75 %	25 %	0 %	409246501
127	NT_187115	CAC	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
128	NT_187115	CTG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
129	NT_187115	CTT	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
130	NT_187115	CAC	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
131	NT_187115	A	7	7	8554	8560	100 %	0 %	0 %	0 %	409246501
132	NT_187115	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
133	NT_187115	GGC	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
134	NT_187115	TCG	2	6	8719	8724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
135	NT_187115	AAG	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246502
136	NT_187115	CCG	2	6	8781	8786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246502
137	NT_187115	GCG	2	6	8818	8823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
138	NT_187115	CGCTG	2	10	8827	8836	0 %	20 %	40 %	40 %	409246502
139	NT_187115	TATC	2	8	8840	8847	25 %	50 %	0 %	25 %	409246502
140	NT_187115	TTG	2	6	8914	8919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246502
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142	NT_187115	A	7	7	9030	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	409246502
143	NT_187115	GCT	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
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153	NT_187115	TATC	2	8	9566	9573	25 %	50 %	0 %	25 %	409246502
154	NT_187115	ACC	2	6	9608	9613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246503
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156	NT_187115	GC	3	6	9681	9686	0 %	0 %	50 %	50 %	409246503
157	NT_187115	CGG	2	6	9687	9692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
158	NT_187115	GAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246503
159	NT_187115	GC	3	6	9738	9743	0 %	0 %	50 %	50 %	409246503
160	NT_187115	GC	3	6	9753	9758	0 %	0 %	50 %	50 %	409246503
161	NT_187115	CGG	2	6	9792	9797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
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165	NT_187115	GCG	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
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167	NT_187115	TGG	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246504
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173	NT_187115	CGA	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246504
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211	NT_187115	CGG	2	6	12439	12444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246507
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242	NT_187115	ATC	2	6	13534	13539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246508
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246	NT_187115	AGT	2	6	13727	13732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246508
247	NT_187115	AAC	2	6	13856	13861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246508
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252	NT_187115	GAC	2	6	14099	14104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246508
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256	NT_187115	GCG	2	6	14174	14179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246508
257	NT_187115	CAC	2	6	14368	14373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246508
258	NT_187115	CG	3	6	14380	14385	0 %	0 %	50 %	50 %	409246508
259	NT_187115	GCA	2	6	14493	14498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246508
260	NT_187115	GTA	2	6	14534	14539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246508
261	NT_187115	ATA	2	6	14830	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246509
262	NT_187115	GCA	2	6	14905	14910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
263	NT_187115	GAA	2	6	14934	14939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246509
264	NT_187115	CAT	3	9	15032	15040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246509
265	NT_187115	GAA	2	6	15051	15056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246509
266	NT_187115	GC	3	6	15067	15072	0 %	0 %	50 %	50 %	409246509
267	NT_187115	CAT	4	12	15147	15158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246509
268	NT_187115	GGAAT	2	10	15161	15170	40 %	20 %	40 %	0 %	409246509
269	NT_187115	GGT	2	6	15176	15181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246509
270	NT_187115	CGGCAA	2	12	15206	15217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
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274	NT_187115	ACT	2	6	15322	15327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246509
275	NT_187115	CGA	2	6	15329	15334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
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281	NT_187115	TGA	2	6	15763	15768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246509
282	NT_187115	CTGGT	2	10	15781	15790	0 %	40 %	40 %	20 %	409246509
283	NT_187115	CAA	2	6	15818	15823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246509
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285	NT_187115	CG	3	6	15986	15991	0 %	0 %	50 %	50 %	409246509
286	NT_187115	CA	3	6	16022	16027	50 %	0 %	0 %	50 %	409246509
287	NT_187115	GAA	2	6	16044	16049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246509
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290	NT_187115	ACG	2	6	16168	16173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
291	NT_187115	ATC	2	6	16259	16264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246510
292	NT_187115	ATT	2	6	16265	16270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246510
293	NT_187115	CGC	2	6	16282	16287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
294	NT_187115	TGC	2	6	16345	16350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246510
295	NT_187115	ACA	2	6	16368	16373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246510
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297	NT_187115	GAT	2	6	16415	16420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246510
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299	NT_187115	GCC	2	6	16585	16590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
300	NT_187115	CAG	2	6	16628	16633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246510
301	NT_187115	CGG	3	9	16687	16695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246510
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334	NT_187115	CGG	2	6	18539	18544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246511
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343	NT_187115	CACC	2	8	18823	18830	25 %	0 %	0 %	75 %	409246511
344	NT_187115	CTCA	2	8	18854	18861	25 %	25 %	0 %	50 %	409246511
345	NT_187115	CCA	2	6	18883	18888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246511
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372	NT_187115	GCAC	2	8	20041	20048	25 %	0 %	25 %	50 %	409246512
373	NT_187115	CGC	2	6	20060	20065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246512
374	NT_187115	ACC	2	6	20074	20079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246512
375	NT_187115	ACC	2	6	20086	20091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246512
376	NT_187115	TGA	2	6	20267	20272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246512
377	NT_187115	ACG	2	6	20338	20343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246512
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379	NT_187115	TCA	2	6	20405	20410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246512
380	NT_187115	TTCC	2	8	20688	20695	0 %	50 %	0 %	50 %	409246513
381	NT_187115	TAAT	2	8	20710	20717	50 %	50 %	0 %	0 %	409246513
382	NT_187115	TGCG	2	8	20862	20869	0 %	25 %	50 %	25 %	409246513
383	NT_187115	ATC	2	6	20894	20899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246513
384	NT_187115	GGC	2	6	20950	20955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246513
385	NT_187115	ATG	2	6	20976	20981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246513
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387	NT_187115	T	6	6	21167	21172	0 %	100 %	0 %	0 %	409246513
388	NT_187115	GC	4	8	21336	21343	0 %	0 %	50 %	50 %	409246513
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498	NT_187115	GCCGC	2	10	26513	26522	0 %	0 %	40 %	60 %	409246520
499	NT_187115	ATG	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246520
500	NT_187115	CAG	2	6	26596	26601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246520

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